Folgende Instrumente zur Nachwuchsförderung sind etabliert, mit dem Ziel, junge Wissenschaftler mit fachlicher Kompetenz und innovativen Ideen auszubilden:
Das Konzept der Nachwuchsgruppen bietet eine Fördermöglichkeit für ambitionierte Wissenschaftler mit hervorragenden Leistungen. Die Gruppen werden einem Institut bzw. einer Klinik zugeordnet und arbeiten dort selbständig. Die Leiter werden unter Beteiligung des Beirates ausgewählt und evaluiert.
Das Nachwuchswissenschaftler-Programm ist ein Programm für junge, diplomierte Naturwissenschaftler oder promovierte Mediziner, die eigenständig kleine Projekte, die an laufenden IZKF Projekten angegliedert werden, mit eigenem Budget bearbeiten. Die Nachwuchswissenschaftler werden außerdem im MD PhD Programm integriert.