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Masters thesis Examining the role of SERBP1 during Salmonella infection

The bacterial pathogen Salmonella enterica Typhimurium (STm) invades host cells in the gut by injecting a cocktail of toxic effector proteins. Once injected, the effector proteins hijack a range of host defence mechanisms that ultimately reconfigure host cells into a protective niche that supports STm proliferation. Together with Jörg Vervoorts-Weber (Laboratory of cell cycle regulation, Uniklinik Aachen), we have found that the STm effector SteC phosphorylates a host protein called SERBP1. SERBP1 normally protects host cells under stress by blocking protein translation. This project will examine the function of SteC-mediated phosphorylation of SERBP1 during STm infection, and its impact on STm pathogenesis.

This link directs you to a short video clip describing the steps of STm infection. Courtesy of the Hardt Laboratory (ETH, Zurich).

This project will be conducted in close collaboration with the Jörg Vervoorts-Weber Lab.

Important techniques:

Eukaryotic and bacterial genetics, handling and cultivation of both bacterial and mammalian cells, in vitro Salmonella infection, expression and purification of recombinant proteins, kinase activity assays, SDS-PAGE, microscopy, Flow Cytometry, Click-chemistry, cloning.

Selected Publication:

  1. Global mapping of Salmonella enterica-host protein-protein interactions during infection. Walch P*, Selkrig J*, Knodler LA, Rettel M, Stein F, Fernandez K, Viéitez C, Potel CM, Scholzen K, Geyer M, Rottner K, Steele-Mortimer O, Savitski MM, Holden DW, Typas A. Cell Host Microbe. 2021 Aug 11;29(8):1316-1332.e12.
  2. Spatiotemporal proteomics uncovers cathepsin-dependent macrophage cell death during Salmonella infection.Selkrig J, Li N, Hausmann A, Mangan MSJ, Zietek M, Mateus A, Bobonis J, Sueki A, Imamura H, El Debs B, Sigismondo G, Florea BI, Overkleeft HS, Kopitar-Jerala N, Turk B, Beltrao P, Savitski MM, Latz E, Hardt WD, Krijgsveld J, Typas A. Nat Microbiol. 2020 Sep;5(9):1119-1133.

Please send your application with CV and transcript of marks to:

Jun-Prof. Joel Selkrig
jselkrigukaachende

Institute for Medical Microbiology
Uniklinik RWTH Aachen
Pauwelsstrasse 30
52074 Aachen

Masterarbeit zur Untersuchung der Rolle von SERBP1 während der Salmonelleninfektion

Der bakterielle Erreger Salmonella enterica Typhimurium (STm) dringt durch Injektion eines Cocktails toxischer Effektorproteine im Darms in Wirtszellen ein. Nach der Injektion manupulieren die Effektorproteine eine Reihe von Abwehrmechanismen der Wirtszellen so dass die Wirtszellen schließlich in eine schützende Nische umgewandelt werden und die Vermehrung von STm unterstützten. Zusammen mit Jörg Vervoorts-Weber (Labor für Zellzyklusregulation, Uniklinik Aachen) haben wir herausgefunden, dass der STm-Effektor SteC ein Wirtsprotein namens SERBP1 phosphoryliert. Normalerweise schützt SERBP1 die Zelle in Stresssituationen, in denen es die Translationsaktivität reduziert. In diesem Projekt soll die Funktion der SteC-vermittelten Phosphorylierung von SERBP1 während der STm-Infektion und ihre Auswirkungen auf die Pathogenese von STm untersuchen.

Dieser Link führt Sie zu einem kurzen Videoclip, in dem die Schritte der STm-Infektion beschrieben werden. Mit freundlicher Genehmigung des Hardt-Labors (ETH, Zürich).

Dieses Projekt wird in enger Zusammenarbeit mit dem Jörg Vervoorts-Weber Labor durchgeführt.

Wichtige Techniken:

Eukaryotische und bakterielle Genetik, Handhabung und Kultivierung von Bakterien- und Säugetierzellen, in vitro Salmonella-Infektion, Expression und Reinigung rekombinanter Proteine, Kinase-Aktivitäts-Assays, SDS-PAGE, Mikroskopie, Durchflusszytometrie, Click-Chemie, Klonierungen.

Selected Publication:

  1. Global mapping of Salmonella enterica-host protein-protein interactions during infection. Walch P*, Selkrig J*, Knodler LA, Rettel M, Stein F, Fernandez K, Viéitez C, Potel CM, Scholzen K, Geyer M, Rottner K, Steele-Mortimer O, Savitski MM, Holden DW, Typas A. Cell Host Microbe. 2021 Aug 11;29(8):1316-1332.e12.
  2. Spatiotemporal proteomics uncovers cathepsin-dependent macrophage cell death during Salmonella infection.Selkrig J, Li N, Hausmann A, Mangan MSJ, Zietek M, Mateus A, Bobonis J, Sueki A, Imamura H, El Debs B, Sigismondo G, Florea BI, Overkleeft HS, Kopitar-Jerala N, Turk B, Beltrao P, Savitski MM, Latz E, Hardt WD, Krijgsveld J, Typas A. Nat Microbiol. 2020 Sep;5(9):1119-1133.

Ihr Bewerbung mit Lebenslauf und Notenspiegel sende Sie bitte an:

Jun-Prof. Joel Selkrig
jselkrigukaachende
Institute for Medical Microbiology
Uniklinik RWTH Aachen
Pauwelsstraße 30
52074 Aachen